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学术报告九十五:基于深度学习的单细胞聚类与标注

时间:2021-10-15 10:43

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数学与统计学院学术报告[2021] 095

(高水平大学建设系列报告595)

报告题目: 基于深度学习的单细胞聚类与标

报告人:邓明华  教授(北京大学

报告时间:20211019日(2:00-3:00 pm

报告地点:腾讯会议(306 192 541

报告内容:本报告将给大家汇报本课题组近期在单细胞RNA-Seq数据分析上的两个工作ScziDeskScSemiCluster. 单细胞RNA-Seq技术现在成为了生物学研究的基本手段,但其高噪声和稀疏性为数据分析带来了挑战。细胞聚类和细胞标注是单细胞测序数据分析的最基本内容,我们融合聚类和基于深度学习的非线性降维方法,开发了聚类方法scziDesk; 进一步结合领域适应(Domain Adaptation)方法,开发了细胞标注方法scSemiCluster, 模拟数据和实际数据分析表明了算法的有效性。

报告人简历:邓明华,男,北京大学威尼斯wns9778教授。19879-19981月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。20038月晋升为副教授,2006年任博士生导师,20098月晋升为教授。其间20012月-20038月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究工作,20098-20101月美国耶鲁大学访问副教授。邓明华从事生物信息学研究,发表SCI论文80余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1863项目,参加3973项目和1项科技部重点研发项目。

欢迎感兴趣的师生参加!

 

                       数学与统计学院

                                                20211015